2'-F-dU Fosforamidiet

2'-F-dU Fosforamidiet neemt 2′-fluor-2′-deoxyuridine op in synthetische oligonucleotiden. De 2′-fluormodificatie verhoogt op dramatische wijze de thermische stabiliteit van duplexen gevormd met complementair RNA (ΔTm ≈ +2–3°C per modificatie) vergeleken met DNA of zelfs 2′-O-methyl-RNA, terwijl het ook uitzonderlijke weerstand biedt tegen afbraak van nucleases. 2'-F-dU Fosforamidiet is bijzonder waardevol bij siRNA-ontwerp, waarbij 2′-F-modificaties in de sense-streng off-target-effecten kunnen verminderen en de metabolische stabiliteit kunnen verbeteren zonder de RNAi-activiteit in gevaar te brengen. 2'-F-dU Fosforamidiet wordt ook gebruikt bij de ontwikkeling van aptameer, omdat de 2′-F-modificatie de chemische diversiteit van aptameerbibliotheken vergroot en de in vivo halfwaardetijd verbetert. De uridinebase heeft geen exocyclische aminebeschermende groep nodig (in tegenstelling tot C, A of G), waardoor 2'-F-dU-fosforamidiet eenvoudiger te ontschermen is - standaard geconcentreerde ammoniak- of AMA-behandeling verwijdert de cyanoethylgroep en splitst het oligonucleotide van de drager, zonder extra stappen voor het ontschermen van de base. 2'-F-dU Fosforamidiet is volledig compatibel met standaard DNA/RNA-synthesizers, hoewel de koppelingstijden mogelijk moeten worden verlengd (6–10 minuten) vanwege het elektronenzuigende effect van het fluoratoom.

Productparameters

Waarom Cosperpharm? – Onze concurrentievoordelen

Synthetische route

Onder argonbescherming werd 5'-O-(4,4'-dimethoxytrifenylmethyl)-2'-deoxy-2'-fluoruridine (3,00 g, 5,47 mmol) opgelost in watervrij dichloormethaan (50 ml). N,N-diisopropylethylamine (0,55 ml, 3,18 mmol), 1H-tetrazool (0,45 g, 6,45 mmol) en bis(2-cyaanethylamino)(2-cyaanethoxy)fosfine (1,92 g, 6,36 mmol) werden achtereenvolgens toegevoegd. Het reactiemengsel werd een nacht bij kamertemperatuur geroerd. Nadat de voltooiing door middel van TLC was bevestigd, werd een waterige oplossing van 5% natriumbicarbonaat (20 ml) toegevoegd om de lagen te scheiden; de organische laag werd gewassen met een verzadigde zoutoplossing (20 ml). Na drogen met watervrij natriumsulfaat werd de organische laag onder verminderde druk geconcentreerd. Het ruwe product werd gezuiverd door silicagelkolomchromatografie met behulp van een hexaan/ethylacetaatmengsel dat 3% triethylamine bevatte (van 75:25 tot 30:70, v/v). De fractie die het doelproduct bevatte, werd verzameld en onder verminderde druk geconcentreerd, wat (2R,3R,4R,5R)-2-(bis(4-methoxyfenyl)(fenyl)methoxy)methyl)-5-(2,4-dioxo-3,4-dihydropyrimidine-1(2H)-yl)-4-fluor-4-hydroxytetrahydrofuran-3-yl(2-cyaanethyl)disoisoprofosfamide (2,76 g) opleverde. rendement 67,3%).

Kwaliteitsborging bij Cosperpharm

Elke batch ondergaat:

● Gaschromatografie (GC) – zuiverheid ≥97,0%

● Niet-waterige titratie – zuiverheid ≥97,0%

● Brekingsindex – bevestigende analyse

● ¹H NMR – structurele verificatie

● Uiterlijk – kleurloze tot lichtgele tot lichtoranje heldere vloeistof

Elke zending wordt vergezeld van een uitgebreid COA, MSDS (met volledige GHS-informatie) en een certificaat van oorsprong.

Neem contact met ons op

Heeft u een betrouwbare bron van 2'-F-dU-fosforamidiet nodig voor uw oligonucleotidesyntheseprogramma? Cosperpharm biedt hoogzuiver monomeer, volledige analytische documentatie en deskundige technische ondersteuning, van onderzoek tot commerciële schaal. Neem vandaag nog contact met ons op.